Libros de historietas de 192 páginas en blanco y negro más cubiertas en color, encuadernados en rústica, con sobrecubiertas.

Samurai Deeper Kyo (サムライ ディーパー キョウ Samurai Dīpā Kyō?) es una serie de manga escrita e ilustrada por Akimine Kamijō. Apareció por primera vez el 26 de mayo de 1999 en el Shōnen Magazine de Kōdansha y fue publicado hasta el 10 de mayo de 2006, en 38 tankōbon. El manga condujo a la adaptación de una serie de anime, en 2002, con el mismo nombre y que Studio Deen emitió en TV Tokyo desde el 2 de julio hasta el 23 de diciembre de 2002, en 26 episodios.​ La historia también ha sido adaptada a un videojuego de Game Boy Advance publicado en Japón en el 2002, y en América en el 2008 siendo el último juego para la consola portátil.

La historia narra la búsqueda de Kyō ojos de ogro para reclamar su cuerpo. En el manga, se revela que todo el clan Mibu, a excepción de Kyō, es descendiente de las «muñecas de batalla», criaturas creadas por dicho clan, para luchar para su diversión. Con el tiempo, las muñecas de batalla terminan creyendo que son el clan Mibu verdadero, y que el clan Mibu verdadero en realidad fue destruido por luchas internas.

Los miembros del clan Mibu existentes están muriendo gradualmente por la «enfermedad de la muerte», conocida también como “la enfermedad de Mibu”. La hermana de Muramasa fue la primera en morir por ello, pero las muertes continuaron en otros miembros. La enfermedad se manifiesta cuando la persona infectada alcanza cierta edad. Por esta razón, el proceso del envejecimiento se ha parado en Antera, Tokito y probablemente en otros.

Kyoshirō Mibu es un vendedor de medicinas ambulante y conoce en el camino a Yuya Shiina, una cazarrecompensas que quiere ganar dinero a costa suya, ya que dice que Kyoshirō es buscado porque es un gran samurái.​ Sin embargo, durante el viaje, en el camino de Nikkōkai, se encuentran con un kenyō, monstruos que aparecieron en Sekigahara después de la batalla. Dentro del cuerpo de Kyoshirō aparece también Kyō como resultado de haber sido golpeados durante su batalla por un portal demoniaco.​ A partir de ahí Kyō y Kyoshirō se alternan en la posesión del cuerpo mientras se descubre la verdadera historia de ambos en el clan Mibu. Durante el camino son atacados por varios kenyō y otros antiguos compañeros de Kyō que quieren hacerse con su cuerpo.